Массу чистых семян исследуемой культуры, выраженную в процентах к общей массе семян, называют чистотой семян. Для определения чистоты семян из среднего образца берут две навески установленного размера. Размер навесок для растений различных групп (в г): для пшеницы, ржи, ячменя, овса, гречихи, вики, чечевицы - 50; кукурузы, гороха, нута, фасоли, арахиса, белого и желтого люпина, клещевины - 200; подсолнечника, сои, чины, арбуза, тыквы - 100; свеклы, конопли, сорго, суданской травы, эспарцета - 25; льна, кориандра - 10; горчицы, рапса, рыжика, люцерны, клевера - 5; тимофеевки луговой, житняка, ежи сборной - 2.
Каждую навеску обычно разделяют на четыре фракции: семена основной культуры; отходы основной культуры (битые, щуплые, проросшие и др.); живой сор (семена сорняков и других культур, семена, пораженные спорыньей и головней, личинки насекомых); мертвый сор (полова, обломки соломы, комочки земли, песок и др.).
Каждую фракцию взвешивают отдельно с точностью до 0,01 г и вычисляют в процентах от взятой навески с точностью до 0,01 %. Кроме того, подсчитывают количество семян других культурных растений и семян сорняков и определяют, сколько их (в шт.) в 1 кг исследуемого образца. При необходимости подсчитывают количество головневых образований, склероциев спорыньи и других грибов с точностью до 0,01 %. При этом массу чистых семян определяют вычитанием из навески общей массы всех фракций сора и зерновой примеси.
Среднеарифметический процент чистых семян основной культуры по двум навескам показывает чистоту семенного материала. Если процент чистоты ниже установленного стандартом, такие семена считаются некондиционными по чистоте, их не допускают к посеву и подвергают вторичной очистке. Не допускаются к посеву и те партии семян, в которых обнаружены семена карантинных сорняков.